1990年，台湾艺校大学二春秋的吴倩莲参演首部电影，与刘德华主演《天若有情》，赢得第十届香港电影金像奖最美新艺人提名·

1993年，与郭富城主演《天若有情2之齐人好猎》。

1994年1月，推出首张片面专辑《宇宙荡子不独你一人》，夺得十大汉文金曲最有前途新秀金奖、叱吒乐坛生力军女歌手铜奖；主演李安执导的电影《饮食男女》。

1996年，与张国荣联袂主演电影《夜半歌声》，荣赢得“长春国际电影节”最美女主角；同庚，与周润发主演电影《祥和饭铺》；与刘德华再次配合，主演《天若有情3之焰火美人》

1998年，与任贤齐配合，主演诸华台湾台顾记挂拍摄的电顾记挂剧《神雕侠侣》，吴倩莲饰演小龙女一角；同庚，与黎明主演许鞍华执导的电影《半生缘》，赢得第17届香港电影金像奖最美女主角提名，荣赢得第四届香港电影影评学会最美女主角。

2000年，与李亚鹏主演的诸华要地电顾记挂剧《京港爱情线》在燕京电顾记挂台第一套节目的黄金档播出，吴倩莲在剧中饰演方明一角。

2002年吴倩莲出任自身网站的CEO。2005年，在电顾记挂剧《阮玲玉》中出演阮玲玉一角。2005年，在胡军主演的电顾记挂剧《楚汉风浪》中饰演吕雉一角。

2006年，在汗青电顾记挂剧中《北魏冯太后》出演第一女主角，饰演16岁到49岁的冯太后。

2013年1月，参演的电顾记挂剧《唐朝顺手豪杰》播出，饰演叶塘莲一角。